磁絮凝污水處理設備工藝也包括三個階段:

第一階段:磁絮凝反應

使污染物質形成絮體并與磁粉進行結合，終形成大而密實的磁絮團。含磁絮團的沉淀過程與普通絮凝過程大體相似，不同的是添加了高比重的磁粉后膠體顆粒與磁粉顆粒之間相互聚集，zui后絮凝產生的絮團比重遠遠高于普通絮凝的絮團。因而沉降速度得到大幅提升。

第二階段:固液分離

高速固液分離過程是依靠磁絮團自身的比重使得其能夠形成高達40mh以上的靜沉速度，從而快速將污染物質從水體中分離出來。

第三階段:磁粉回收

磁絮團經過高速剪切機破碎后進入磁分離器中，一方面將碰粉回收至反應池中進行循環使用。另一方面分離后的污泥排入污泥儲池進行后續污泥脫水處理。

磁絮凝與磁分離工藝是在傳統絮凝沉淀工藝的基礎上，增加了磁粉加載反應池、高剪切器以及磁分離器等設備。